108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1939 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  328  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1927  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0324999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  26.42 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  26.17 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  23.77 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  28.18 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  25.86 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 184 aa  43.9  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  27.16 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  23.97 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  25.29 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  32.86 
 
 		 156 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 149 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>