More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0065 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  51.47 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  45.67 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.55 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.55 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.21 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.29 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.29 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.46 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.08 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.33 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.76 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.49 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  29.63 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  35.56 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.29 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.29 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  32.65 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  33.57 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.21 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  29.5 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.03 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  33.79 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  33.57 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.33 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.17 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  46.88 
 
 		 208 aa  63.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  36.05 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  30.2 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  42.53 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  34.09 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  48.21 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  43.08 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.17 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.85 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.79 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.37 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.43 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.14 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.47 
 
 		 282 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.21 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  42.42 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.38 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  43.4 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  43.94 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  44.64 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.69 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  45.28 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.17 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  27.91 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.03 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  41.82 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.71 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  34.53 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.39 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.5 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.86 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  48.21 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.38 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.82 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  32.82 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  47.37 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.53 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  41.67 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  47.37 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.3 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.38 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  32.14 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.1 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  51.85 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.47 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  45 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  31.82 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  30.25 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  31.72 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>