More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2953 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  79.59 
 
 		 245 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  83.27 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  69.26 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  64.2 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  63.37 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  67.35 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  59.61 
 
 		 257 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  58.78 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  54.22 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  55.6 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  58.78 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  57.14 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  55.1 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  51 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  52.23 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  51.23 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  47.56 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  46.41 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  46.91 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.74 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  49.16 
 
 		 594 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  48.15 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  49.38 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  47.74 
 
 		 597 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  45.56 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  45.71 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  44.44 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  46.22 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  46.96 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  45.49 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  42.28 
 
 		 266 aa  204  8e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.5 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  44.35 
 
 		 267 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  47.72 
 
 		 484 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  47.48 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  43.03 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  44.98 
 
 		 621 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.3 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  43.1 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  41.13 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.73 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.33 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  42.62 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  44.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  44.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  44.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.98 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.98 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  40.41 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  40.96 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  40.96 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  40.96 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  42.62 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  43.03 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.98 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  42.04 
 
 		 261 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  41.77 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  43.16 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  42.62 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.02 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  39.75 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.87 
 
 		 859 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.62 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  38.93 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  44.96 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  38.93 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  39.92 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  40.93 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  39.75 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  38.67 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  41.39 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  43.09 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  40.89 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40.16 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  38.21 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  39.52 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  41.95 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  38.93 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.57 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  46.59 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  40.96 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  40.76 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  42.57 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  43.93 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>