More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2186 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2186  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0548516  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4731  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.944783  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  32.6 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3390  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2151  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1421  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2344  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6701  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3398  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61994  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0453  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3499  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 273 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1249  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4732  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.69 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 199 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6337  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  26.52 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 309 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 334 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 334 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3616  GGDEF  41.59 
 
 		 124 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.142982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  30.36 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 333 aa  99  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 345 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  26.16 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 313 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 331 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 329 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 356 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  35.57 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1911  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  45.87 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>