77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3243 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 974 aa  1979    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  31.75 
 
 		 490 aa  108  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  25.07 
 
 		 514 aa  101  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  25.07 
 
 		 514 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  29.25 
 
 		 516 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.23 
 
 		 510 aa  99.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  25.75 
 
 		 514 aa  99  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  25.27 
 
 		 514 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  41.91 
 
 		 492 aa  97.8  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  33.33 
 
 		 524 aa  97.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  26.88 
 
 		 517 aa  97.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  33.51 
 
 		 203 aa  95.9  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  32.65 
 
 		 517 aa  95.1  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  37.14 
 
 		 500 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  32.7 
 
 		 541 aa  92.8  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  31.37 
 
 		 607 aa  92.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  31.44 
 
 		 516 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  33.7 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  30.89 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  27.52 
 
 		 533 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  33.16 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  30 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  34.53 
 
 		 284 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  29.73 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  30.16 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  32 
 
 		 285 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  30.98 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  33.82 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.78 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  28.99 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  32.59 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  62  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  30.92 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  34.17 
 
 		 281 aa  60.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  29.57 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  28.4 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  31.91 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  23.75 
 
 		 1017 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  25.43 
 
 		 1078 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  34.56 
 
 		 307 aa  56.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 304 aa  56.2  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  25.65 
 
 		 991 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  27.7 
 
 		 271 aa  55.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1079 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  24.86 
 
 		 1078 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.32 
 
 		 803 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  29.85 
 
 		 287 aa  55.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  28.15 
 
 		 273 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.9 
 
 		 782 aa  53.5  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  28.28 
 
 		 876 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  31.97 
 
 		 304 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  27.14 
 
 		 251 aa  52.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  31.9 
 
 		 311 aa  52.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  31.67 
 
 		 261 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  31.09 
 
 		 286 aa  50.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  23.73 
 
 		 835 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  33.05 
 
 		 266 aa  50.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.17 
 
 		 248 aa  49.3  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  32.14 
 
 		 332 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  30.53 
 
 		 287 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  26.01 
 
 		 759 aa  48.5  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  28.46 
 
 		 296 aa  48.9  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  26.09 
 
 		 819 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  28.49 
 
 		 248 aa  48.1  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  25.28 
 
 		 983 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  30.22 
 
 		 339 aa  47.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  28.47 
 
 		 262 aa  46.2  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.6 
 
 		 307 aa  45.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  26.26 
 
 		 301 aa  45.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  32.63 
 
 		 749 aa  45.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  29.59 
 
 		 842 aa  45.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.61 
 
 		 982 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>