More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2866 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  100 
 
 		 299 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.63 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  45.04 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  47.43 
 
 		 267 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  45.45 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  45.24 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.86 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  44.19 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  40.64 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  44.4 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  45.45 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  45.88 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  43.92 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  46.34 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  42.63 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  45.8 
 
 		 276 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  46.34 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  42.34 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  42.23 
 
 		 258 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.57 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  44.05 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.52 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.78 
 
 		 265 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  45.85 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  41.64 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  41.98 
 
 		 263 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  44.27 
 
 		 274 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  44.44 
 
 		 266 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  45.06 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  43.14 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.27 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  45.97 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  40.68 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  43.87 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  42.46 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  45.06 
 
 		 258 aa  205  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  43.03 
 
 		 255 aa  205  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  45.56 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  46.03 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  41.06 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  41.92 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.35 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  44.44 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.7 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 		 233 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  45.49 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  42.74 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  41.54 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.98 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  43.82 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  47.64 
 
 		 275 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  44.72 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.85 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  41.54 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 273 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.57 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  41.87 
 
 		 264 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.15 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  42 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  45.37 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.94 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  45.42 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  42.58 
 
 		 274 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  39.76 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.38 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.97 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  39.44 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  41.13 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  44.31 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 278 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  45 
 
 		 253 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  39.92 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  41.13 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  43.14 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  38.65 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.1 
 
 		 286 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  41.46 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  39.6 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.99 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  43.88 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  40.94 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.74 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>