89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2290 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 376 aa  778    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  70.78 
 
 		 377 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  70.51 
 
 		 377 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  68.98 
 
 		 381 aa  544  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  69.38 
 
 		 387 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  50.41 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  49.73 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  49.32 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  50.68 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  50 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  49.46 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  50.41 
 
 		 389 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  48.63 
 
 		 365 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  48.63 
 
 		 365 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  48.91 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  48.09 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  47.81 
 
 		 365 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  48.5 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  48.5 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  48.23 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  46.35 
 
 		 417 aa  338  7e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  46.45 
 
 		 365 aa  338  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.1 
 
 		 414 aa  338  8e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  48.15 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  39.74 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  40.81 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  37.11 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  39.04 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  36.7 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  38.92 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  36.51 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  34.65 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  37.74 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  37.11 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  35.36 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  36.18 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  38.27 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  37.23 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  37.23 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  36.65 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  34.55 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  36.02 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  36.7 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  34.51 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  38.96 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  34.5 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  35.64 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  33.07 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  36.46 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.84 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  34.32 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  35.58 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  35.03 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  32.08 
 
 		 406 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  35.29 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.75 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.05 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.47 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  31.66 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  32.98 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 		 1086 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 		 1058 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 		 1055 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 		 1113 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 		 1076 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.27 
 
 		 1134 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.44 
 
 		 1110 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.82 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  33.07 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  25.36 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  24.47 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  24.4 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  27.06 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0160  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.56 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  27.06 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  25.1 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  23.46 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  27.06 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  23.77 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  20.95 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  24.58 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0485  diaminopimelate decarboxylase  24.1 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  27.06 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  22.09 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  22.8 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  21.56 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>