235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3871 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 924 aa  1922    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.14 
 
 		 918 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.51 
 
 		 1056 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.86 
 
 		 951 aa  539  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.48 
 
 		 1088 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 1149 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.57 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.57 
 
 		 923 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.11 
 
 		 738 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  25.56 
 
 		 686 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 		 806 aa  101  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.62 
 
 		 892 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  24.51 
 
 		 677 aa  97.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  22.6 
 
 		 889 aa  96.3  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.72 
 
 		 781 aa  95.1  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.27 
 
 		 763 aa  93.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  23.67 
 
 		 1046 aa  93.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 803 aa  93.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  21.57 
 
 		 781 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.57 
 
 		 1026 aa  90.9  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.6 
 
 		 785 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  23.2 
 
 		 1020 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  25.84 
 
 		 1043 aa  89  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  21.61 
 
 		 590 aa  88.6  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.6 
 
 		 614 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  23.94 
 
 		 601 aa  87.4  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.58 
 
 		 815 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.36 
 
 		 1084 aa  86.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.11 
 
 		 644 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 1084 aa  85.1  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 984 aa  85.1  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.92 
 
 		 1045 aa  85.1  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.74 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.01 
 
 		 598 aa  84.7  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  23.38 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 		 1077 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  23.8 
 
 		 1063 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 945 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  22 
 
 		 607 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24.73 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  23.1 
 
 		 604 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  21.66 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  26.53 
 
 		 1036 aa  80.1  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  23.13 
 
 		 1023 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 925 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.44 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.48 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.8 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.38 
 
 		 1019 aa  77.4  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.96 
 
 		 1033 aa  77.4  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.8 
 
 		 913 aa  76.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  23.71 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  22.82 
 
 		 603 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  22.82 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  24.09 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.47 
 
 		 1129 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 951 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  22.82 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  24.09 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.56 
 
 		 794 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 		 1020 aa  75.5  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.46 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.66 
 
 		 1108 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  22.37 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  22.08 
 
 		 1076 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 806 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  20.86 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  23.78 
 
 		 603 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.73 
 
 		 928 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  22.6 
 
 		 603 aa  74.3  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  22.74 
 
 		 575 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  24.34 
 
 		 1015 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 603 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  22.2 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.77 
 
 		 1424 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  21.05 
 
 		 734 aa  72  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.21 
 
 		 1781 aa  71.2  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 987 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.75 
 
 		 621 aa  70.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.18 
 
 		 858 aa  70.1  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 1049 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.3 
 
 		 595 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.19 
 
 		 620 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  22.35 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.86 
 
 		 1004 aa  69.3  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.59 
 
 		 824 aa  69.3  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.46 
 
 		 824 aa  68.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  21.37 
 
 		 1045 aa  68.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.78 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.6 
 
 		 992 aa  68.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  22.98 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 1079 aa  68.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.93 
 
 		 1036 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.97 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.57 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  21.55 
 
 		 1050 aa  67.8  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  21.55 
 
 		 1066 aa  67.8  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.25 
 
 		 986 aa  67  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  21.53 
 
 		 625 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>