More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2810 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 450 aa  940    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  56.18 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  54.59 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  46.48 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  41.5 
 
 		 459 aa  362  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  37.9 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  37.12 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  32.87 
 
 		 460 aa  259  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  37.4 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  36.1 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  34.6 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  32.19 
 
 		 426 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  30.41 
 
 		 728 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0827  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 687 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  28.07 
 
 		 1048 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  28.81 
 
 		 524 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 479 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0544  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 758 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 510 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1052  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 		 674 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 		 562 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 511 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.33 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2652  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 682 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.84 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 541 aa  107  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.57 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.37 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.81 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.42 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.28 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  24.53 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 586 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.01 
 
 		 575 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 543 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  24.72 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.57 
 
 		 594 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.57 
 
 		 594 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.57 
 
 		 594 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.57 
 
 		 594 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1154  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 		 752 aa  97.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  25.68 
 
 		 537 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3664  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.42 
 
 		 659 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186742  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 587 aa  96.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.47 
 
 		 626 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.14 
 
 		 608 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.48 
 
 		 574 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.55 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  23.68 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.29 
 
 		 594 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  23.76 
 
 		 586 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  25.2 
 
 		 1146 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.53 
 
 		 533 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 528 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.46 
 
 		 579 aa  93.6  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3868  alpha amylase catalytic region  22.76 
 
 		 752 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  24.69 
 
 		 1151 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.54 
 
 		 626 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  25.05 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.64 
 
 		 1021 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  23.18 
 
 		 558 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  30.33 
 
 		 682 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.46 
 
 		 1433 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 		 635 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  24.26 
 
 		 528 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3802  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.87 
 
 		 590 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300682  normal  0.0163414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  25.23 
 
 		 537 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  23.19 
 
 		 586 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 537 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  28.42 
 
 		 1022 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.12 
 
 		 605 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3716  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.84 
 
 		 636 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  24.64 
 
 		 493 aa  90.1  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  22.98 
 
 		 586 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.98 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  23.23 
 
 		 606 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  32.8 
 
 		 615 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  24.65 
 
 		 654 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  23.71 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.3 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  23.93 
 
 		 660 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.51 
 
 		 607 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 576 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 		 651 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3733  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.69 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  27.97 
 
 		 675 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.38 
 
 		 736 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.97 
 
 		 605 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  27.48 
 
 		 646 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  24.02 
 
 		 752 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  22.74 
 
 		 663 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.37 
 
 		 584 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 1131 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.81 
 
 		 589 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>