More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1594 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  100 
 
 		 548 aa  1133    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  40.65 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  37.05 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  35.01 
 
 		 564 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  34.84 
 
 		 563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 563 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  34.16 
 
 		 564 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  34.24 
 
 		 577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 562 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  33.93 
 
 		 571 aa  316  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  32.92 
 
 		 571 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  33.27 
 
 		 567 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  32.91 
 
 		 568 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  32.16 
 
 		 574 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.97 
 
 		 575 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  32.49 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  33.69 
 
 		 575 aa  300  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  33.21 
 
 		 568 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  31.36 
 
 		 568 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  28.08 
 
 		 567 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  31.66 
 
 		 383 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 561 aa  216  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  28.75 
 
 		 565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  26.66 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 567 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  27.08 
 
 		 577 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 550 aa  207  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  29.16 
 
 		 393 aa  170  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  32.72 
 
 		 367 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 378 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  30.03 
 
 		 369 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 373 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  29.22 
 
 		 415 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  32.05 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.7 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 377 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.41 
 
 		 384 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  24.94 
 
 		 434 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  39.44 
 
 		 414 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  26.9 
 
 		 380 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.19 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  25.25 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.56 
 
 		 1177 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.46 
 
 		 391 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  37.76 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  26.9 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.36 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  24.57 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  25.87 
 
 		 380 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  22.97 
 
 		 397 aa  100  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  25.87 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.21 
 
 		 392 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  25.87 
 
 		 380 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  25.87 
 
 		 380 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 406 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.35 
 
 		 308 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.35 
 
 		 308 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  29.71 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  25.87 
 
 		 380 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.15 
 
 		 407 aa  97.4  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 1322 aa  97.1  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  25.58 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05729  putative diguanylate cyclase  37.78 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  25.58 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  39.86 
 
 		 1127 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000121  response regulator  38.52 
 
 		 319 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0601608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.71 
 
 		 322 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 331 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 503 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 		 353 aa  95.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.73 
 
 		 400 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 312 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 531 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 312 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 312 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02505  putative response regulator  41.32 
 
 		 306 aa  93.6  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  43.36 
 
 		 705 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.52 
 
 		 328 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.31 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.14 
 
 		 900 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.74 
 
 		 338 aa  92  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 331 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  39.84 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2383  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.59 
 
 		 434 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  35.85 
 
 		 1111 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  28.42 
 
 		 381 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 310 aa  90.9  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 457 aa  90.5  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.81 
 
 		 584 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>