More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04098 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  100 
 
 		 320 aa  629  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  78.65 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  78.65 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  73.01 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  36.72 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  31.35 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  37.36 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  37.36 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  34.38 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  35.59 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  32.75 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  33.45 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  31.09 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  33.55 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  34.38 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  34.63 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  34.32 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  34.32 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  33.95 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  33.55 
 
 		 436 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 424 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  34.94 
 
 		 411 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  31.85 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  32.08 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  35 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.67 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.05 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  32.96 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  32.19 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  32.32 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  32.32 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  32.32 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  32.32 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  32.32 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  32.32 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  32.52 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  30.57 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  29.27 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  31.99 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  34.22 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  32.64 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  32.98 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  36.26 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  28.21 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  31.91 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  33.6 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  32.26 
 
 		 393 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  33.9 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  32.69 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.68 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  32.72 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  32.41 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.04 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.44 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  36.65 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  28.82 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.15 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.15 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  30.21 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  30.64 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  27.11 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  28.72 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  29.61 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  28.01 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  29.61 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  29.61 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  29.61 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  29.61 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  27.38 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  29.28 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  28.9 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  28.9 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.9 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  28.9 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.9 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  31.34 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  27.83 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  30.97 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  27 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>