More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00323 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.7 
 
 		 1091 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 		 1086 aa  738    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  41.49 
 
 		 1082 aa  743    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  42.98 
 
 		 1085 aa  767    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  42.2 
 
 		 1087 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  81.07 
 
 		 1173 aa  1615    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  42.56 
 
 		 1102 aa  764    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.64 
 
 		 1122 aa  781    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  42.89 
 
 		 1085 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  41.1 
 
 		 1095 aa  741    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  100 
 
 		 1166 aa  2332    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1083 aa  765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1156 aa  743    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  42.89 
 
 		 1085 aa  765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  42.5 
 
 		 1087 aa  753    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  42.5 
 
 		 1087 aa  752    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  42.5 
 
 		 1083 aa  774    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  42.89 
 
 		 1085 aa  766    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  42.7 
 
 		 1087 aa  756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.75 
 
 		 1081 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 		 1213 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1050 aa  499  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1043 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1034 aa  469  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1044 aa  446  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1043 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1044 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1017 aa  410  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1055 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1027 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1027 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1087 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1058 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  39.66 
 
 		 1011 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.01 
 
 		 1069 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1028 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1044 aa  366  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1028 aa  365  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1028 aa  364  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1023 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1040 aa  362  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1032 aa  361  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1062 aa  360  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1028 aa  360  9e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1071 aa  360  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 1496 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1036 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1053 aa  355  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1041 aa  354  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1470 aa  350  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1039 aa  350  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1026 aa  348  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1095 aa  347  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1038 aa  346  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1038 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1070 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1041 aa  345  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1057 aa  343  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1070 aa  339  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.33 
 
 		 1024 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1075 aa  333  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1101 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1066 aa  332  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1069 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1048 aa  328  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1079 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1048 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1029 aa  325  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  35.6 
 
 		 1041 aa  323  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.99 
 
 		 1024 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 		 1033 aa  322  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1034 aa  321  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1022 aa  320  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1038 aa  318  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1051 aa  318  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1024 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1024 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1073 aa  315  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1074 aa  314  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1039 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1009 aa  313  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1037 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.79 
 
 		 1068 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1034 aa  311  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1065 aa  310  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1171 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1006 aa  310  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1046 aa  310  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 		 1055 aa  309  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1037 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.45 
 
 		 1040 aa  307  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1058 aa  305  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1043 aa  305  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.44 
 
 		 1036 aa  304  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1059 aa  304  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1050 aa  303  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1031 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1037 aa  301  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1037 aa  301  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1191 aa  300  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>