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for query gene PCC7424_1410 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1410  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
362 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  40.18 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  30.89 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  41.75 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  34.29 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  36.77 
 
 
569 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 
650 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 
648 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  39.32 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  35.9 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.51 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  34.9 
 
 
570 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  37.98 
 
 
562 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  39.32 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  43.96 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  39.05 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  30.49 
 
 
633 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 
590 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.75 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  39.05 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 
533 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  34.09 
 
 
534 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  35.12 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  24.9 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.54 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  44.44 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  44.44 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  37.21 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  37.21 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 
294 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  36.89 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  40.45 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 
662 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  40.66 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  29.65 
 
 
624 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  23.47 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  26.11 
 
 
804 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  33.16 
 
 
682 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  23.83 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  21.95 
 
 
362 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  36.89 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  35.48 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 
424 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  23.14 
 
 
799 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
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NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  34.04 
 
 
627 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  33.98 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
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NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 
296 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  30.65 
 
 
418 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  33.98 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  33.98 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150216 
 
 
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NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  22.81 
 
 
803 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  33.98 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
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