More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15041 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 323 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  69.66 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  69.52 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  51.61 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 284 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 280 aa  275  9e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  51.25 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  48.93 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 279 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  47.86 
 
 		 281 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  47.86 
 
 		 281 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  49.28 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  46.21 
 
 		 407 aa  255  8e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  51.06 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  48.1 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  46.1 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  45.32 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  47.2 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 286 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  49.12 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  47.02 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  45.58 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  44.48 
 
 		 279 aa  225  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 274 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  43.31 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 280 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  43.31 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  43.31 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  43.24 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  41.26 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  42.31 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  40.77 
 
 		 289 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  42.16 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 278 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 275 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 275 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  41.28 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  41.2 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  40.55 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  40.77 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  40.55 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 275 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 292 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 275 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 276 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  39.66 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  41.32 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 286 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.51 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  40.64 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  41.84 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 		 282 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 276 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>