More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 323 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  57.14 
 
 		 315 aa  362  4e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  55.9 
 
 		 302 aa  347  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  49.06 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  47.84 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  47.22 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  41.43 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.94 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  39.56 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  39.63 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  43.03 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  42.4 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  43.03 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  47.96 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  42.46 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  42.42 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  42.91 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  42.54 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  42.48 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  51.16 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  39.61 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  43.3 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  44.24 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  49.04 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  48.82 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  39 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  41.44 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.57 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  46.89 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  39.29 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  39.38 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  39.42 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  43.03 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  40.3 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  35.4 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  37.7 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  40.93 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  36.39 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  40.55 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  35.33 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  37.89 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  35.33 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  43.51 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  38.81 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  34.17 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  45.93 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  41.98 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  43.06 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  42.74 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  37.31 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  44.4 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  40.39 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  37.45 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  39.67 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  41.6 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  38.25 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  33.89 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  39.78 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  42.51 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  42.51 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  40 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  44.04 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  39.83 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  35.97 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  37.94 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  42.51 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  39.08 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  39.26 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  33.89 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  38.08 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  33.11 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  45.41 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  40.31 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  38.34 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  33.44 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  39.33 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>