139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2889 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2889  transcriptional activator FtrB  100 
 
 		 239 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0301  transcriptional activator FtrB  81.36 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025844  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0277  transcriptional activator FtrB  81.36 
 
 		 236 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3861  transcriptional activator FtrB  41.38 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  40.79 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4238  transcriptional activator FtrB  38.16 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 293 aa  128  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  32.88 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  27.15 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1580  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.75 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5024  cyclic nucleotide-binding protein  30.05 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.17 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.85 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  26.05 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4954  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00163752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  25.13 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2636  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  23.98 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  23.5 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2635  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.545323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  24.34 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  24.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  24.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1622  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  25.5 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  25.26 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.35 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3081  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0390484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  22.83 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  25.65 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  24.12 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  26.16 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 482 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  23.21 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  21.74 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  22.28 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  23.37 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  22.27 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  20.6 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  22.83 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  22.83 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4303  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.95 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  20.69 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  22.04 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 634 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.65 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>