110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0903 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  100 
 
 
821 aa  1646    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.61 
 
 
787 aa  274  6e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  25.35 
 
 
830 aa  226  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  26.49 
 
 
812 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  27.79 
 
 
974 aa  118  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.4 
 
 
974 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.56 
 
 
974 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.99 
 
 
974 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.21 
 
 
974 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.14 
 
 
974 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  26.87 
 
 
973 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  26.55 
 
 
877 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  25.64 
 
 
974 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  32 
 
 
978 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  32 
 
 
978 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  32 
 
 
979 aa  106  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  31.88 
 
 
199 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  31.88 
 
 
199 aa  95.1  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  28.48 
 
 
1280 aa  92.4  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  48.39 
 
 
664 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  21.38 
 
 
883 aa  87.8  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  23.97 
 
 
1065 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  37.31 
 
 
767 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  37.31 
 
 
767 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  34.64 
 
 
1284 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.86 
 
 
1157 aa  82.4  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  25.86 
 
 
711 aa  78.2  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.49 
 
 
1354 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  29.51 
 
 
1144 aa  74.7  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.77 
 
 
1351 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  41.57 
 
 
617 aa  73.9  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  30.14 
 
 
1282 aa  72  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  23.3 
 
 
768 aa  72  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.97 
 
 
1047 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.45 
 
 
1160 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  29.61 
 
 
1153 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  31.45 
 
 
1467 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  23.97 
 
 
1167 aa  67  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  25.38 
 
 
1181 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  30.37 
 
 
1149 aa  67.4  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  40.7 
 
 
94 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  34.58 
 
 
1186 aa  64.3  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  23.83 
 
 
1163 aa  63.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  27.21 
 
 
729 aa  62.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  24.01 
 
 
1171 aa  62.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  31.47 
 
 
1127 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  31.21 
 
 
1126 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  41.18 
 
 
1194 aa  60.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  27.37 
 
 
1167 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  26.12 
 
 
1155 aa  60.1  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  28.12 
 
 
922 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  31.21 
 
 
1126 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.77 
 
 
922 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  36.08 
 
 
885 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  39.73 
 
 
758 aa  58.9  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  39.73 
 
 
758 aa  58.9  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.73 
 
 
723 aa  58.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.01 
 
 
724 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  30.43 
 
 
1156 aa  57.4  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  32.08 
 
 
890 aa  57.4  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  24.32 
 
 
1185 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  28.1 
 
 
1137 aa  56.2  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  31.78 
 
 
878 aa  55.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  25 
 
 
1348 aa  55.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  28.71 
 
 
1414 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  30.08 
 
 
880 aa  55.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  29.82 
 
 
1156 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.95 
 
 
1156 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  24.49 
 
 
1153 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  29.82 
 
 
1156 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  22.79 
 
 
1157 aa  54.3  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  28.14 
 
 
968 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.17 
 
 
901 aa  53.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  28.95 
 
 
1156 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  28.95 
 
 
1156 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  32.43 
 
 
875 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  28.95 
 
 
1156 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  24.06 
 
 
1158 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  29.1 
 
 
1180 aa  52.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  32.99 
 
 
883 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  31.65 
 
 
712 aa  52  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  23.94 
 
 
1179 aa  52  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  31.13 
 
 
798 aa  51.6  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  36.49 
 
 
818 aa  51.2  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  40.43 
 
 
873 aa  51.2  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  38.03 
 
 
910 aa  51.2  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  22.63 
 
 
1181 aa  50.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.52 
 
 
880 aa  50.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  26.76 
 
 
1210 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  35.62 
 
 
817 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  29.41 
 
 
1277 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  44.23 
 
 
1152 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  24.77 
 
 
917 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  40 
 
 
1158 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  42.31 
 
 
1201 aa  49.3  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  31.37 
 
 
877 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  31.37 
 
 
877 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  31.37 
 
 
877 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  26.42 
 
 
1151 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  24.62 
 
 
789 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>