More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0875 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  100 
 
 		 677 aa  1357    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  46.35 
 
 		 665 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  47.72 
 
 		 661 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  47.11 
 
 		 661 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  46.97 
 
 		 661 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  46.17 
 
 		 663 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  47.23 
 
 		 652 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  44.53 
 
 		 674 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  38.69 
 
 		 653 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  37.69 
 
 		 653 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  33.7 
 
 		 620 aa  297  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  33.13 
 
 		 622 aa  295  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 643 aa  293  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.86 
 
 		 637 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  32.33 
 
 		 622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  32.88 
 
 		 639 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  32.72 
 
 		 639 aa  279  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  32.72 
 
 		 671 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  28.91 
 
 		 653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  33.33 
 
 		 632 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  35.86 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 595 aa  212  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  30 
 
 		 789 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  31.53 
 
 		 702 aa  210  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  28.6 
 
 		 647 aa  208  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  28.79 
 
 		 633 aa  187  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  29.94 
 
 		 670 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  26.22 
 
 		 594 aa  184  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 627 aa  181  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  28.15 
 
 		 610 aa  177  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  26.48 
 
 		 588 aa  170  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.36 
 
 		 598 aa  170  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  28.01 
 
 		 627 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  28.9 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  28.99 
 
 		 595 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  28.72 
 
 		 607 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  24.19 
 
 		 613 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  27.35 
 
 		 593 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 709 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  27.69 
 
 		 610 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  25.32 
 
 		 576 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  25.32 
 
 		 618 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 609 aa  123  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  44 
 
 		 779 aa  122  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 558 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  25.98 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  26.06 
 
 		 604 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  25.52 
 
 		 597 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  27.17 
 
 		 575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  26.35 
 
 		 573 aa  111  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 611 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2486  surface antigen (D15)  25.24 
 
 		 611 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  24.64 
 
 		 607 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 583 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  28.42 
 
 		 603 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  24.75 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1752  surface antigen (D15)  26.15 
 
 		 593 aa  106  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1410  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2444  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.21927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1828  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 604 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2439  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 604 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 559 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.11 
 
 		 765 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.25 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  26.26 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.26 
 
 		 752 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1136  surface antigen (D15)  24.84 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.325603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0703  surface antigen (D15)  25.36 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.528109  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.43 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2978  OMP85 family outer membrane protein  24.95 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2308  OMP85 family outer membrane protein  24.95 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0488702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1621  OMP85 family outer membrane protein  24.95 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.419252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2384  putative lipoprotein  24.51 
 
 		 589 aa  101  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00318443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.68 
 
 		 555 aa  101  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1053  OMP85 family outer membrane protein  24.7 
 
 		 605 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1046  OMP85 family outer membrane protein  25.3 
 
 		 605 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0841455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1206  OMP85 family outer membrane protein  24.7 
 
 		 571 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.34 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1013  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 611 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0705  OMP85 family outer membrane protein  25.34 
 
 		 605 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2114  hypothetical protein  22.1 
 
 		 618 aa  98.2  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.86 
 
 		 574 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  34.97 
 
 		 582 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  23.48 
 
 		 682 aa  97.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.4 
 
 		 579 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3981  surface antigen (D15)  23.09 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  22.73 
 
 		 636 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.19 
 
 		 770 aa  95.9  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  32.6 
 
 		 611 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2141  surface antigen (D15)  22.46 
 
 		 591 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 596 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1836  surface antigen (D15)  22.46 
 
 		 591 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 618 aa  94.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0292  outer membrane protein, OMP85 family protein  23.54 
 
 		 578 aa  94.4  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.96 
 
 		 760 aa  94.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.76 
 
 		 749 aa  94.4  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  24 
 
 		 677 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>