More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1536 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  100 
 
 		 625 aa  1247    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  40.57 
 
 		 377 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  40.71 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  41.85 
 
 		 527 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  40.98 
 
 		 504 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  40.83 
 
 		 467 aa  238  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.29 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.75 
 
 		 512 aa  231  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 		 538 aa  230  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  38.01 
 
 		 540 aa  229  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  37.87 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.83 
 
 		 537 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 460 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 		 537 aa  228  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  38.84 
 
 		 537 aa  227  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.25 
 
 		 432 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 472 aa  223  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.88 
 
 		 457 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  40 
 
 		 422 aa  219  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.13 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.77 
 
 		 456 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 683 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.77 
 
 		 627 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  39.1 
 
 		 491 aa  210  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 715 aa  210  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.89 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  37.8 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  36.11 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  36.39 
 
 		 577 aa  203  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  40.07 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 		 518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  36.28 
 
 		 489 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  35.06 
 
 		 478 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  35.62 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  34.92 
 
 		 650 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  37.89 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.48 
 
 		 494 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  36.05 
 
 		 672 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  36.65 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  35.53 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.15 
 
 		 508 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  37.31 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 509 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  38.02 
 
 		 439 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 439 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.04 
 
 		 486 aa  187  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  36.02 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  34.16 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  36.54 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  36.25 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.92 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  33.02 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.92 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 		 498 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  37.46 
 
 		 473 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 502 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  35.98 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1779  secretion protein HlyD  34.18 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0975048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  35.58 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 		 599 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  34.05 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  36.76 
 
 		 513 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 		 552 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  34.13 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  34.28 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  35.44 
 
 		 640 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  35.6 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3401  RND family efflux transporter MFP subunit  36.25 
 
 		 507 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4115  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4766  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 507 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 451 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  37.79 
 
 		 472 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 510 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 473 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.66 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  34.89 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  35.87 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  35.83 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5687  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0349806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 510 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 		 477 aa  171  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  32.21 
 
 		 472 aa  170  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 513 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 514 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 513 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  30.77 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  33.75 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6283  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 509 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0732635  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>