More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1776 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  61.43 
 
 
138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  46.43 
 
 
138 aa  121  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  43.57 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  42.86 
 
 
142 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  42.14 
 
 
141 aa  103  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  43.26 
 
 
136 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  45 
 
 
147 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  43.66 
 
 
143 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  39.04 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  40.41 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  39.73 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  41.73 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  41.55 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  40.88 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  35.25 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  35.51 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  39.29 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  39.04 
 
 
145 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  40.88 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  38.56 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  35.92 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  35.42 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.14 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.86 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  32.37 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  33.09 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.71 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  36.62 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.43 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.62 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  40.21 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.62 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  34.31 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  32.86 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.75 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  42.14 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36.55 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.79 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  35.95 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  32.12 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.1 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
449 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.86 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.51 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  39.01 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.87 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.48 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  38.61 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  38.61 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.11 
 
 
305 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.69 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.82 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  38.61 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.72 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.57 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.89 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  31.33 
 
 
295 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.51 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
515 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.87 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.14 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  34.62 
 
 
314 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.06 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.97 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  43.48 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.07 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36.67 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.11 
 
 
170 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.11 
 
 
170 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.09 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.86 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.71 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  33.78 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.33 
 
 
320 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.66 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.17 
 
 
304 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.66 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.29 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
289 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.21 
 
 
288 aa  60.1  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>