More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0617 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  57.69 
 
 		 161 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  37.19 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  31.53 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.69 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  33.66 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  32.58 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1243  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0356088  normal  0.548993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  29.25 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.2 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 296 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>