More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1559 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  55.21 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  56.28 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  54.12 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  44.85 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  53.19 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  45.83 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  44.1 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  43.54 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 245 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 188 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 266 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  36.31 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  51.25 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  33.15 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  53.33 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  48.1 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.03 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.88 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
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NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
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NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
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NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
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NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  37.86 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
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NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  40.71 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
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NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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