133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0489 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  100 
 
 		 832 aa  1634    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  42.52 
 
 		 575 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  41.74 
 
 		 1560 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  44.63 
 
 		 996 aa  187  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 1077 aa  184  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 1282 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 1119 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  39.72 
 
 		 973 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  39.73 
 
 		 1281 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  44.65 
 
 		 1148 aa  172  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.37 
 
 		 957 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  39.45 
 
 		 950 aa  171  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  40 
 
 		 974 aa  171  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1182 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  40.91 
 
 		 1092 aa  168  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  43.72 
 
 		 1164 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  37.99 
 
 		 1051 aa  167  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  39.62 
 
 		 950 aa  167  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.03 
 
 		 1049 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  39.18 
 
 		 1023 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  36.19 
 
 		 1004 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  37.16 
 
 		 905 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.01 
 
 		 879 aa  159  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 1007 aa  158  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  38.53 
 
 		 854 aa  157  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  39.85 
 
 		 1047 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 851 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 851 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 851 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 1132 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 1268 aa  151  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 860 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  37.67 
 
 		 1060 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  36.6 
 
 		 797 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  37.1 
 
 		 836 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  35.96 
 
 		 1022 aa  147  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  37.33 
 
 		 763 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  32.83 
 
 		 829 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  35.42 
 
 		 1031 aa  145  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  37.56 
 
 		 965 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  37.16 
 
 		 807 aa  144  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 803 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  36.2 
 
 		 854 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  39.29 
 
 		 683 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  32.15 
 
 		 991 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  34.57 
 
 		 801 aa  140  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  37.61 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  35.94 
 
 		 669 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  37.84 
 
 		 1026 aa  137  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  36.99 
 
 		 697 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  34.4 
 
 		 841 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  35.21 
 
 		 832 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  36.4 
 
 		 818 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.51 
 
 		 670 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  35.32 
 
 		 637 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  36.24 
 
 		 817 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  34.91 
 
 		 1000 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.37 
 
 		 687 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  39.7 
 
 		 863 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  35.98 
 
 		 895 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  38.5 
 
 		 876 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  29.6 
 
 		 735 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.09 
 
 		 733 aa  128  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  34.23 
 
 		 821 aa  128  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  35.11 
 
 		 798 aa  126  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.83 
 
 		 817 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  37.25 
 
 		 769 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.37 
 
 		 839 aa  122  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  35.35 
 
 		 1402 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.44 
 
 		 799 aa  121  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  34.13 
 
 		 839 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  36.15 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  34.4 
 
 		 843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  36.57 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  37.11 
 
 		 1152 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.05 
 
 		 1310 aa  117  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.62 
 
 		 794 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  33.9 
 
 		 764 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  34.23 
 
 		 805 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  29.17 
 
 		 1076 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  33.03 
 
 		 814 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  32.22 
 
 		 436 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.19 
 
 		 516 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  31.63 
 
 		 484 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  28.44 
 
 		 630 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  29.85 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 412 aa  87.4  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  29.85 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  30.6 
 
 		 600 aa  81.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  27.87 
 
 		 524 aa  77  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.46 
 
 		 539 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.69 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 606 aa  52  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 444 aa  51.2  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.3 
 
 		 473 aa  51.2  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3790  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 689 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 310 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>