122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0681 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  26.78 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  46.3 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 367 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 201 aa  45.1  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0117  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  39.22 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 385 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 477 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 477 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  42.22 
 
 		 510 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>