More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0422 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0422  trypsin-like serine protease  100 
 
 		 471 aa  948    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  37.59 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4019  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.39 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0482  serine protease  31.46 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3093  trypsin-like serine proteases typically periplasmic  29.37 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0647718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  32.46 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  30.64 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  30.49 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  27.31 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  32.73 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  31.79 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  26.76 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  29.02 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  30.37 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  31.28 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  29.83 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.7 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  24.84 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.55 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.84 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.4 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  32.8 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  31.73 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  33.15 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  24.74 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  31.87 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  27.64 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  25.78 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  32.45 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  32.11 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  31.72 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  30.41 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  32 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  31.94 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  33.15 
 
 		 514 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  31.43 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  32.71 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  32 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.96 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  28.42 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  31.91 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  31.12 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  32.12 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  31 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.93 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.63 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  29.55 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  30.1 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  29.44 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  28.74 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  32.83 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  29.32 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  27.13 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.73 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.98 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.2 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  31.22 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  30.65 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.19 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.61 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  29.85 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.6 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  29.1 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  29.15 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  27.98 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  32.49 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.19 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  29.17 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.15 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.91 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.44 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  30.48 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.18 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  32.45 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  31.32 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  32.08 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  29.23 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  27.84 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  31.35 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  32.52 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  30.96 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.1 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  31.89 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  31.69 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  30.96 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  31.32 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  24.83 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  31.35 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  28.57 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  26.64 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  26.53 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  26.34 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  29.53 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  29.49 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>