116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5519 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  58.66 
 
 		 755 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  55.5 
 
 		 750 aa  656    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  71.1 
 
 		 732 aa  833    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  68.89 
 
 		 729 aa  753    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  80.43 
 
 		 761 aa  1009    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  68.67 
 
 		 723 aa  833    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  70.99 
 
 		 738 aa  833    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 725 aa  1409    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  50.89 
 
 		 755 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  50.72 
 
 		 791 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  50.07 
 
 		 794 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  49.78 
 
 		 740 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.24 
 
 		 712 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  37.18 
 
 		 757 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  37.04 
 
 		 771 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.37 
 
 		 772 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.91 
 
 		 771 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.6 
 
 		 772 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.86 
 
 		 763 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.6 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.46 
 
 		 755 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  32.1 
 
 		 789 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  36.95 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.48 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  34.94 
 
 		 739 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.38 
 
 		 760 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.76 
 
 		 759 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.19 
 
 		 776 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.24 
 
 		 770 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.22 
 
 		 1362 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.96 
 
 		 786 aa  325  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.32 
 
 		 753 aa  310  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  30.74 
 
 		 819 aa  290  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  35.48 
 
 		 831 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  36.35 
 
 		 796 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  32.95 
 
 		 711 aa  267  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  35.26 
 
 		 774 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.35 
 
 		 795 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.46 
 
 		 691 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.96 
 
 		 701 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.55 
 
 		 1033 aa  240  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.19 
 
 		 812 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.71 
 
 		 776 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.2 
 
 		 671 aa  208  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 775 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.63 
 
 		 713 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.94 
 
 		 680 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.3 
 
 		 833 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.16 
 
 		 840 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.92 
 
 		 1109 aa  91.3  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  33.14 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.53 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.22 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.94 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.27 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.69 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 421 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  32.54 
 
 		 523 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  22.86 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.21 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  35.77 
 
 		 942 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.25 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.38 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.26 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  32.8 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 411 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  28.57 
 
 		 490 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.07 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 		 393 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 		 480 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  24.08 
 
 		 571 aa  52  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.88 
 
 		 460 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 547 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.88 
 
 		 472 aa  51.6  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 		 505 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 1077 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3093  von Willebrand factor type A  32.39 
 
 		 340 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 550 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 		 464 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  22.96 
 
 		 426 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 615 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>