99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0418 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  100 
 
 		 436 aa  859    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  39.33 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  40.85 
 
 		 451 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  39.72 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  37.58 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  40.75 
 
 		 451 aa  269  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  34.52 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  36.47 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  38.91 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  38.12 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  35.48 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  37.36 
 
 		 439 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  38.43 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  38.53 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  35.33 
 
 		 490 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  39.5 
 
 		 448 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  31.17 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  37.02 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  27.8 
 
 		 611 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  24 
 
 		 631 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  27.98 
 
 		 709 aa  57  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  24.4 
 
 		 614 aa  53.9  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  26.19 
 
 		 727 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  23.41 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  26.45 
 
 		 736 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  27.04 
 
 		 709 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  23.19 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 		 284 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  22.54 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  23.77 
 
 		 578 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  26.94 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  22.37 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  22.54 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  27.22 
 
 		 697 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  23.27 
 
 		 701 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  35.65 
 
 		 714 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  25.11 
 
 		 627 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.65 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  25.11 
 
 		 628 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  26.32 
 
 		 741 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 316 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 336 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  24.75 
 
 		 701 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 		 365 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.33 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 291 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 291 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1586  secretion protein HlyD  27.89 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000231295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  29.53 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  24.67 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  24.46 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  24.85 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  22.61 
 
 		 702 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  43.64 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  25.22 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 289 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  30.61 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  23.91 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  30.61 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 289 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  30.28 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  29.73 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  36.07 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  30.06 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  23.71 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 337 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  21.36 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  22.9 
 
 		 288 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.45 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  30.61 
 
 		 411 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  39.22 
 
 		 521 aa  43.5  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  35.29 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  22.44 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>