114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1138 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  286  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  29.51 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  29.81 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.44 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  38.1 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  36.49 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 163 aa  42.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  22.68 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  31.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 321 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 157 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 165 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  25.66 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  22.61 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  22.5 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 329 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.81 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>