152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3108 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  24.66 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.28 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  25.87 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 167 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  35.11 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  26.97 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.36 
 
 		 304 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 312 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  30.84 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  26.32 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  32.79 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  38.46 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.57 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.11 
 
 		 158 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  42.55 
 
 		 158 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 163 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  29.73 
 
 		 312 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>