More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4885 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  87.71 
 
 		 183 aa  314  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  73.45 
 
 		 183 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  73.45 
 
 		 183 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  73.45 
 
 		 183 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  65.17 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  49.73 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  49.42 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  39.55 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  41.46 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  38.41 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  33.73 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  32.93 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  34.32 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  32.12 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  31.14 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  31.79 
 
 		 286 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.09 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.76 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 903 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  25.97 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.08 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 493 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  31.72 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  31.72 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  29.78 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.97 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 447 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 359 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  26.04 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  27.81 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  27.81 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  27.11 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  27.81 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  29.53 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.73 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.28 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.05 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 		 576 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.85 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  26.99 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  27.53 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  26.01 
 
 		 266 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.75 
 
 		 600 aa  61.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.83 
 
 		 319 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 515 aa  61.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  22.67 
 
 		 448 aa  61.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  22.75 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  28.1 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  31.16 
 
 		 517 aa  61.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  25.7 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  28.1 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.83 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.81 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 862 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  32.35 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  28.21 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 844 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.77 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.57 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>