297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4118 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  85 
 
 		 180 aa  315  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  76.63 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  76.63 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  76.63 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  61.8 
 
 		 183 aa  215  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 173 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  62.01 
 
 		 187 aa  198  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  45.9 
 
 		 390 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 237 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 194 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 438 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 253 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  43.55 
 
 		 232 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 324 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  43.14 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 247 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 278 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  31.13 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 233 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>