More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3827 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  79.1 
 
 		 508 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  91.73 
 
 		 496 aa  796    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  100 
 
 		 496 aa  967    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  89.26 
 
 		 503 aa  786    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  89.26 
 
 		 503 aa  786    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  71.81 
 
 		 504 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  98.19 
 
 		 496 aa  943    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  70.24 
 
 		 502 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  87.82 
 
 		 501 aa  789    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  52.79 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  55.42 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  51.82 
 
 		 526 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  53.96 
 
 		 523 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  50.47 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  52.47 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  52.65 
 
 		 527 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  53.75 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  53.28 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  49.91 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  51.06 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  55.58 
 
 		 537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  46.3 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  46.99 
 
 		 527 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  46.42 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  47.8 
 
 		 520 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  49.69 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  49.69 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  46.17 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.19 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.56 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  50 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  45.64 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  46.32 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.83 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  47.07 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.64 
 
 		 511 aa  346  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  45.44 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.49 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.15 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.23 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  50.75 
 
 		 524 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  40.15 
 
 		 528 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.27 
 
 		 487 aa  336  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.86 
 
 		 483 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.66 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.92 
 
 		 506 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.04 
 
 		 524 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  41.23 
 
 		 523 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.91 
 
 		 514 aa  333  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.92 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  43.22 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.99 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  43.84 
 
 		 501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.08 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  43.01 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  43.47 
 
 		 497 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 		 508 aa  326  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.76 
 
 		 501 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  40.78 
 
 		 501 aa  323  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.98 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  39.92 
 
 		 522 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.35 
 
 		 535 aa  319  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  43.34 
 
 		 516 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  45.76 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.55 
 
 		 498 aa  316  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.58 
 
 		 485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  42.86 
 
 		 501 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.37 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.67 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.89 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.72 
 
 		 518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.38 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  46.85 
 
 		 578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  44.44 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.68 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  44.2 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.7 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.42 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.24 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  42.05 
 
 		 515 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  41.29 
 
 		 496 aa  299  9e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  43.21 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  41.92 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.79 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.05 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  42.47 
 
 		 505 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.62 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.38 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.66 
 
 		 476 aa  295  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.21 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  41.51 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.09 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.49 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.57 
 
 		 479 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  39.42 
 
 		 502 aa  293  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.48 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  41.14 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>