110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0602 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  69.57 
 
 
621 aa  954    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
621 aa  1279    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  52.66 
 
 
627 aa  700    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  70.21 
 
 
621 aa  959    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  70.05 
 
 
621 aa  959    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  31.52 
 
 
604 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  28.1 
 
 
644 aa  280  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  29.26 
 
 
642 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  28.12 
 
 
644 aa  249  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  30.29 
 
 
647 aa  236  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  27.86 
 
 
647 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  29.2 
 
 
673 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  24.96 
 
 
663 aa  217  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  27.14 
 
 
650 aa  212  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  26.76 
 
 
668 aa  210  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  25.83 
 
 
645 aa  209  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.58 
 
 
670 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  26.44 
 
 
649 aa  187  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  26.95 
 
 
622 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.43 
 
 
569 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  24.85 
 
 
611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  26.03 
 
 
615 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  25.43 
 
 
615 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  29.06 
 
 
363 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  23.01 
 
 
610 aa  112  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.48 
 
 
622 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  25.54 
 
 
602 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  24.18 
 
 
584 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  23.48 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 
412 aa  70.1  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.76 
 
 
803 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.04 
 
 
802 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  23.6 
 
 
596 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  25.58 
 
 
435 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  23.57 
 
 
592 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  21.5 
 
 
870 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  23.57 
 
 
592 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  25.58 
 
 
435 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  28.11 
 
 
484 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  19.82 
 
 
621 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.57 
 
 
801 aa  62.4  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  21.59 
 
 
617 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  19.93 
 
 
612 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  19.84 
 
 
632 aa  59.7  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  22.19 
 
 
583 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  18.64 
 
 
869 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.51 
 
 
761 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  20.39 
 
 
487 aa  57.4  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  24.66 
 
 
1061 aa  57  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  20.22 
 
 
629 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  32.04 
 
 
549 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  24.73 
 
 
472 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  25.89 
 
 
619 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  22.41 
 
 
407 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  20.58 
 
 
613 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  21.81 
 
 
402 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  21.74 
 
 
604 aa  53.9  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.13 
 
 
840 aa  53.9  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.28 
 
 
800 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.23 
 
 
803 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  24.1 
 
 
593 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  22.17 
 
 
578 aa  52.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  19.48 
 
 
608 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.52 
 
 
838 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.39 
 
 
692 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.39 
 
 
681 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.04 
 
 
837 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  22.14 
 
 
599 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  20.43 
 
 
597 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  18.69 
 
 
616 aa  51.2  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  22.22 
 
 
835 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  20.39 
 
 
626 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  22.67 
 
 
623 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  19.48 
 
 
608 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  19.85 
 
 
817 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.11 
 
 
1505 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  22.56 
 
 
625 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.73 
 
 
841 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.17 
 
 
798 aa  48.9  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1988  hypothetical protein  20.27 
 
 
725 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  19.26 
 
 
610 aa  48.9  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  23.83 
 
 
847 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.49 
 
 
820 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.05 
 
 
860 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  23.18 
 
 
599 aa  48.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.47 
 
 
715 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  19.74 
 
 
601 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  20.82 
 
 
593 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  19.43 
 
 
635 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  21.08 
 
 
611 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  19.91 
 
 
594 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  22.19 
 
 
627 aa  46.2  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1604  hypothetical protein  26.39 
 
 
1050 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.593088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1547  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.91 
 
 
1050 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425239  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5525  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.47 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  20 
 
 
786 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  19.14 
 
 
627 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  21.57 
 
 
606 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  21.1 
 
 
609 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  20 
 
 
605 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>