138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0751 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0751  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
392 aa  801    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0711  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.84 
 
 
310 aa  298  9e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.067675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2165  CRISPR-associated protein Cas1  46.05 
 
 
327 aa  279  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.770952  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1196  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 
303 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0452668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0439  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  40.2 
 
 
310 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.2 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  26.76 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  26.75 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  25.97 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.88 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.86 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2282  CRISPR-associated protein Cas1  25.08 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.27 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  29.49 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.14 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  24.46 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  23.49 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  22.79 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.19 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1275  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.06 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0357154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.24 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.24 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.56 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  24.46 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0114  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.53 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0232185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  26.49 
 
 
691 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  24.72 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.73 
 
 
320 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.51 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  24.36 
 
 
335 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.43 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  29.46 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  24.59 
 
 
325 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  20.26 
 
 
330 aa  63.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.91 
 
 
330 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1074  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.22 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.29 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  22.18 
 
 
331 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.44 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  20.14 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  27.48 
 
 
525 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.94 
 
 
731 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  22.83 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.18 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.72 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.2 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  24.19 
 
 
727 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  30.71 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  22.31 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  24.21 
 
 
207 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  24.87 
 
 
731 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  30.84 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  34.83 
 
 
346 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1123  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.72 
 
 
294 aa  56.6  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0138486  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.76 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.22 
 
 
559 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.83 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.28 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.77 
 
 
306 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  31.78 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  23.02 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.22 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.83 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.48 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.95 
 
 
580 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.07 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.32 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  25.76 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.14 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.21 
 
 
342 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  19.86 
 
 
328 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.56 
 
 
332 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  23.85 
 
 
570 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  30 
 
 
346 aa  52.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.94 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.52 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.2 
 
 
330 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  30.16 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.7 
 
 
338 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.14 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.03 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  24.16 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.45 
 
 
338 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  21.24 
 
 
330 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  20.54 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.19 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  25.66 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  21.62 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  23.65 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  28.8 
 
 
553 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  23.74 
 
 
594 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  21.59 
 
 
598 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  25.88 
 
 
339 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  24.1 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  20.66 
 
 
322 aa  50.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  25.96 
 
 
259 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  29.66 
 
 
343 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>