245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5675 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5675  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
994 aa  1960    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.23 
 
 
1557 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.89 
 
 
1553 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 
1236 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.87 
 
 
1523 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.26 
 
 
1481 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.54 
 
 
1211 aa  96.3  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.11 
 
 
1652 aa  94.7  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.9 
 
 
1217 aa  94.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.88 
 
 
1357 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 
1240 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 
696 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.6 
 
 
1363 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.9 
 
 
947 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.64 
 
 
1334 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.86 
 
 
1280 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.55 
 
 
1364 aa  86.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.65 
 
 
1196 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.85 
 
 
1510 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.31 
 
 
1599 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.88 
 
 
1454 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 
1807 aa  84  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
1711 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.09 
 
 
1188 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.4 
 
 
1213 aa  82  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  26.76 
 
 
608 aa  82  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  19.58 
 
 
1760 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.81 
 
 
1626 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 
1656 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.2 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.89 
 
 
1831 aa  78.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 
1161 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.46 
 
 
1190 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.21 
 
 
1100 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.79 
 
 
1598 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 
1161 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  24.75 
 
 
1399 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.18 
 
 
742 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1623 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  25.18 
 
 
1491 aa  75.5  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.2 
 
 
1163 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.33 
 
 
1190 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.03 
 
 
1097 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.19 
 
 
930 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  28.53 
 
 
342 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.1 
 
 
1188 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.01 
 
 
1193 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  20.62 
 
 
1474 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.49 
 
 
1901 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 
1177 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  23.95 
 
 
1230 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.5 
 
 
1484 aa  72  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.51 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.71 
 
 
943 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.89 
 
 
630 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2909  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 
544 aa  70.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000595828  decreased coverage  0.00000399472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.57 
 
 
1164 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  21.08 
 
 
960 aa  69.7  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.49 
 
 
1076 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.2 
 
 
692 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.65 
 
 
1609 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 
1789 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.64 
 
 
676 aa  68.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  27.6 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.99 
 
 
1267 aa  68.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.71 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  23.41 
 
 
589 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 
406 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.74 
 
 
1242 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.49 
 
 
919 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 
406 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.62 
 
 
677 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.56 
 
 
1209 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  26.01 
 
 
516 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 
1766 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.91 
 
 
1684 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.55 
 
 
1262 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.12 
 
 
1221 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
443 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.09 
 
 
1443 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22 
 
 
1547 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.64 
 
 
657 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.23 
 
 
464 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28.91 
 
 
1355 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.8 
 
 
642 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.7 
 
 
698 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  20.98 
 
 
1348 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 
1878 aa  62.4  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.6 
 
 
1208 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.8 
 
 
1868 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.25 
 
 
1304 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.37 
 
 
317 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 
1686 aa  62  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.46 
 
 
1416 aa  61.6  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.2 
 
 
1344 aa  61.6  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22 
 
 
1176 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 
914 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.91 
 
 
740 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24 
 
 
1247 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>