More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2909 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2909  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 544 aa  1053    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000595828  decreased coverage  0.00000399472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1510 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1211 aa  134  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 		 1363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 		 1481 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.74 
 
 		 1652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 		 1163 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.88 
 
 		 919 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.39 
 
 		 1523 aa  120  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.82 
 
 		 1357 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.69 
 
 		 1364 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.94 
 
 		 947 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.64 
 
 		 1217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.93 
 
 		 924 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1229 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1196 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 		 696 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.33 
 
 		 1188 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.21 
 
 		 1344 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 1221 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 		 1236 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 		 1557 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1789 aa  93.6  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1807 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.98 
 
 		 1454 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.36 
 
 		 676 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.84 
 
 		 1262 aa  91.3  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25.61 
 
 		 1416 aa  90.5  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.63 
 
 		 642 aa  90.5  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.71 
 
 		 1831 aa  88.2  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.14 
 
 		 317 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.7 
 
 		 1161 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 		 1311 aa  86.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.23 
 
 		 1161 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.71 
 
 		 1193 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.19 
 
 		 1240 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1711 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  27.82 
 
 		 1100 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1474 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  26.19 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 		 1686 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.54 
 
 		 930 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.11 
 
 		 1348 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1041 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.16 
 
 		 1213 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.28 
 
 		 1280 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1367 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.48 
 
 		 1247 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.27 
 
 		 1623 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.68 
 
 		 1901 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1190 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.27 
 
 		 1607 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.67 
 
 		 740 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  29.43 
 
 		 1699 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.03 
 
 		 943 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.04 
 
 		 1443 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.54 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  18.96 
 
 		 1188 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.16 
 
 		 1856 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.06 
 
 		 608 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.69 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  31.12 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.48 
 
 		 1599 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1552 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1477 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  32.69 
 
 		 790 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 		 344 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.54 
 
 		 1878 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.65 
 
 		 1484 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.36 
 
 		 1766 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  27.87 
 
 		 1733 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.18 
 
 		 1598 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.96 
 
 		 1760 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.81 
 
 		 1039 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.29 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.95 
 
 		 698 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  20.71 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1661 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1491 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  31.25 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.37 
 
 		 742 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.19 
 
 		 692 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.48 
 
 		 1617 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.62 
 
 		 1208 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  30.14 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.44 
 
 		 737 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.19 
 
 		 1205 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.61 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 316 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5675  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 		 994 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.82 
 
 		 1164 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1399 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  30.47 
 
 		 840 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.49 
 
 		 1656 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  25.69 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  33.9 
 
 		 405 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>