291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0640 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  95.79 
 
 
570 aa  1055    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  74.13 
 
 
572 aa  837    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  66.73 
 
 
546 aa  753    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  99.82 
 
 
559 aa  1117    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
559 aa  1118    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  56.58 
 
 
547 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  54.55 
 
 
546 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  52.14 
 
 
544 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  46.57 
 
 
580 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  46.75 
 
 
568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  46.69 
 
 
579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  47.21 
 
 
545 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  42.12 
 
 
553 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  40.83 
 
 
557 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  38.45 
 
 
563 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  39.29 
 
 
568 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  37.81 
 
 
563 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 
551 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  31.9 
 
 
540 aa  229  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.47 
 
 
541 aa  223  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  32.43 
 
 
538 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  33.21 
 
 
532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  31.39 
 
 
539 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  31.1 
 
 
520 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  31.85 
 
 
535 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  33.7 
 
 
538 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  28.09 
 
 
552 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 
541 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  31.55 
 
 
532 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  34.34 
 
 
525 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  31.75 
 
 
547 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 
539 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 
547 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  34.61 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  34.61 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  30.9 
 
 
526 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  30.04 
 
 
551 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  32.69 
 
 
528 aa  187  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  32.13 
 
 
527 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  32.1 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.53 
 
 
593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  28.06 
 
 
522 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  29.76 
 
 
519 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.65 
 
 
587 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.28 
 
 
587 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 
600 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.27 
 
 
533 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.47 
 
 
587 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  28.92 
 
 
551 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  29.55 
 
 
538 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  28.42 
 
 
556 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3264  flagellar MS-ring protein  30.85 
 
 
558 aa  177  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.48 
 
 
677 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  31.39 
 
 
530 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  31.07 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.23 
 
 
576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  28.52 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.54 
 
 
566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  30.38 
 
 
539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  30.37 
 
 
519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.35 
 
 
544 aa  173  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
544 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  29.52 
 
 
542 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.51 
 
 
571 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 
587 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  29.6 
 
 
563 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 
587 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.03 
 
 
603 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.79 
 
 
587 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  29.32 
 
 
536 aa  171  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  29.98 
 
 
509 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  32.31 
 
 
524 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  26.7 
 
 
539 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  28.25 
 
 
566 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 
598 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 
598 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  30.51 
 
 
537 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.37 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  29.6 
 
 
564 aa  166  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  28.76 
 
 
529 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  29.6 
 
 
564 aa  166  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  30.75 
 
 
500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  28.4 
 
 
595 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  31.07 
 
 
543 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  30.19 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  30.89 
 
 
504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  31.22 
 
 
588 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  30.61 
 
 
580 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  27.53 
 
 
569 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  30.62 
 
 
594 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  27.75 
 
 
611 aa  160  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  28.6 
 
 
552 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  30.73 
 
 
548 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2559  flagellar M-ring protein FliF  31.79 
 
 
533 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00858256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  27.87 
 
 
567 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  31.71 
 
 
533 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>