228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0425 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  42.92 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0492  LmbE family protein  41.55 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  39.91 
 
 		 227 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  40.27 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  37.16 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  38.57 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  40.09 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  38.07 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  44.08 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  36.92 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  43.05 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  37.9 
 
 		 225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  39.64 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  37.79 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  36.36 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  31.53 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2173  LmbE family protein  35.84 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2248  hypothetical protein  33.63 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  33.62 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0611  LmbE family protein  33.48 
 
 		 569 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  33.18 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  29.26 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  32.73 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  30.84 
 
 		 302 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  31.48 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  26.76 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.89 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.89 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.73 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  28.89 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.89 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.89 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  28.37 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.26 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  25.79 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  26.73 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  26.32 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  28.39 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  26.44 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  25.86 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  28.99 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.36 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  28.07 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7997  LmbE family protein  27.78 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  26.29 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  24.41 
 
 		 308 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  25.76 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  25.66 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0374  LmbE family protein  25.93 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  27.31 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  27.95 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.21 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  27.54 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  26.43 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  22.75 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  28.86 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1823  LmbE family protein  25.3 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.318027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  27.81 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  24.87 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.35 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 350 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  27.51 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  23.38 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  28.57 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  25.74 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  26.69 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.19 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.96 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  24.05 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  30.51 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  23.61 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.49 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  23.26 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.51 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38410  uncharacterized LmbE-like protein  24.68 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  27.94 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  26.16 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.71 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  26.4 
 
 		 265 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  22.97 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  27.27 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  29.19 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  25.11 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  26.88 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  24.61 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  27.96 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  27.96 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>