More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3005 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  51.29 
 
 		 1194 aa  1157    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  49.8 
 
 		 1170 aa  1117    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  63.49 
 
 		 1169 aa  1508    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 		 1212 aa  2468    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  43.64 
 
 		 1137 aa  863    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  44.13 
 
 		 1131 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  48.94 
 
 		 1167 aa  1109    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  52.35 
 
 		 1172 aa  1194    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  62.48 
 
 		 760 aa  967    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  73.35 
 
 		 440 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  74.96 
 
 		 814 aa  894    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  50.38 
 
 		 774 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  51.96 
 
 		 829 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  51.97 
 
 		 1168 aa  1194    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  50.2 
 
 		 1167 aa  1128    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  49.14 
 
 		 1167 aa  1112    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  80.13 
 
 		 906 aa  1475    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  63.39 
 
 		 1170 aa  1509    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  44.54 
 
 		 1136 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  67.41 
 
 		 1170 aa  1649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  49.55 
 
 		 1160 aa  1063    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  71.37 
 
 		 1172 aa  1787    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  63.73 
 
 		 1169 aa  1499    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  60.59 
 
 		 1170 aa  1467    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  48.89 
 
 		 1160 aa  1115    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  41.27 
 
 		 964 aa  582  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.76 
 
 		 1129 aa  486  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.49 
 
 		 1116 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.53 
 
 		 1145 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1144 aa  435  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.01 
 
 		 1138 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.16 
 
 		 835 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  67.38 
 
 		 283 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  38.98 
 
 		 1062 aa  352  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  34.55 
 
 		 1147 aa  349  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  37.79 
 
 		 565 aa  321  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.11 
 
 		 988 aa  318  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.82 
 
 		 971 aa  284  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.67 
 
 		 969 aa  274  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  50.19 
 
 		 312 aa  264  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  30.85 
 
 		 925 aa  251  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.55 
 
 		 927 aa  249  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 941 aa  242  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 941 aa  242  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.77 
 
 		 1069 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  31.77 
 
 		 1069 aa  239  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.83 
 
 		 933 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.84 
 
 		 919 aa  233  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.47 
 
 		 966 aa  232  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.12 
 
 		 969 aa  231  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.32 
 
 		 962 aa  229  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.53 
 
 		 877 aa  230  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 1046 aa  214  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  30.1 
 
 		 1057 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 937 aa  211  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 1031 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.37 
 
 		 1045 aa  206  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.43 
 
 		 1049 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.17 
 
 		 952 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.9 
 
 		 1082 aa  202  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.31 
 
 		 1165 aa  202  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  30.89 
 
 		 894 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 1058 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 1177 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  33.13 
 
 		 922 aa  179  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.86 
 
 		 1201 aa  179  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1201 aa  179  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.26 
 
 		 1028 aa  175  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 955 aa  173  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.29 
 
 		 953 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.8 
 
 		 961 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.43 
 
 		 961 aa  161  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 963 aa  161  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  24.16 
 
 		 1013 aa  160  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 		 900 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.85 
 
 		 950 aa  156  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  27.61 
 
 		 1094 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 948 aa  155  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.09 
 
 		 949 aa  153  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  28.57 
 
 		 665 aa  153  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  26.6 
 
 		 957 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 964 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  29.1 
 
 		 346 aa  149  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.24 
 
 		 951 aa  149  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 963 aa  149  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 967 aa  149  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  28.53 
 
 		 916 aa  148  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  28.53 
 
 		 915 aa  147  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.05 
 
 		 915 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 942 aa  146  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  25.62 
 
 		 968 aa  145  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.65 
 
 		 801 aa  145  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.46 
 
 		 921 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.1 
 
 		 805 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  28.97 
 
 		 966 aa  142  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 953 aa  141  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 947 aa  141  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  29.75 
 
 		 932 aa  141  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.34 
 
 		 975 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  27.91 
 
 		 929 aa  139  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>