155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00089 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  100 
 
 		 87 aa  173  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  43.84 
 
 		 776 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 776 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 730 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  45.21 
 
 		 763 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  43.84 
 
 		 780 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  39.74 
 
 		 732 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 735 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  43.48 
 
 		 811 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  46.48 
 
 		 759 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  44.44 
 
 		 778 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 801 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  44.93 
 
 		 824 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  47.22 
 
 		 709 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  43.59 
 
 		 709 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 699 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.89 
 
 		 600 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 698 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 751 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  43.06 
 
 		 689 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 681 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 751 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 698 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 698 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 681 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 678 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 694 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 692 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 724 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 725 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 742 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 693 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 677 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 677 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 681 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 685 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 682 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 727 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 727 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 		 681 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 694 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 744 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  37.97 
 
 		 681 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 702 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  43.84 
 
 		 709 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  40.26 
 
 		 689 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  42.03 
 
 		 719 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 719 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  37.84 
 
 		 687 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  42.03 
 
 		 714 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  37.84 
 
 		 687 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  42.03 
 
 		 719 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 713 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 751 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  36.49 
 
 		 685 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  40.58 
 
 		 731 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  40.58 
 
 		 723 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  40.58 
 
 		 707 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 818 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 682 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  34.43 
 
 		 799 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 705 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  36.11 
 
 		 801 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 705 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 685 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 733 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  36.11 
 
 		 753 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  41.54 
 
 		 628 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  40.58 
 
 		 714 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 702 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 734 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  41.54 
 
 		 617 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  34.72 
 
 		 745 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 758 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 702 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  34.72 
 
 		 749 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  34.72 
 
 		 749 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  34.38 
 
 		 777 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 698 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  33.78 
 
 		 710 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  33.78 
 
 		 709 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  33.78 
 
 		 710 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  33.78 
 
 		 710 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  35.14 
 
 		 713 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 249 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  38.96 
 
 		 764 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.63 
 
 		 696 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 698 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  33.78 
 
 		 758 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 676 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 698 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  33.78 
 
 		 758 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 698 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  34.72 
 
 		 687 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 706 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  33.78 
 
 		 758 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  33.78 
 
 		 758 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.63 
 
 		 696 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 784 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>