245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2236 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  65.41 
 
 		 511 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  91.8 
 
 		 500 aa  928    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  63.89 
 
 		 511 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1021    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  80.2 
 
 		 500 aa  831    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  60.36 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  49.8 
 
 		 498 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  51.86 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  52.73 
 
 		 524 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  49.71 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  49.36 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  48.69 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  49.37 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  47.22 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  44.56 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  47 
 
 		 520 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  39.5 
 
 		 519 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  37.71 
 
 		 549 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  37.57 
 
 		 1033 aa  353  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  37.08 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  35.91 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 		 539 aa  297  3e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  35.51 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  35.98 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  35.82 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  35.61 
 
 		 463 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  35.61 
 
 		 463 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  28.48 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  28.28 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.55 
 
 		 449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  28.48 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 722 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  27.25 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  28.54 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.73 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  24.3 
 
 		 459 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  26.24 
 
 		 538 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  27.91 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.7 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  25.37 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.16 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.59 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.71 
 
 		 491 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.03 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  24.39 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  25.96 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  23.31 
 
 		 424 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.29 
 
 		 1293 aa  90.9  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  26.18 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  21.91 
 
 		 431 aa  87.4  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  20.17 
 
 		 428 aa  87  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  29.85 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  21.61 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  26.06 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  31.64 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.95 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2341  UDP-galactopyranose mutase  32.72 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0608  UDP-galactopyranose mutase  26.95 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  27.98 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  21.91 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.34 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  30.54 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  27.98 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.55 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  27.27 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  22.78 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  28.74 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 460 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  45.33 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  26.79 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  27.78 
 
 		 393 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  29.26 
 
 		 434 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  27.38 
 
 		 396 aa  53.9  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  26.98 
 
 		 394 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0717  UDP-galactopyranose mutase  28.93 
 
 		 365 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  26.22 
 
 		 381 aa  53.5  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.83 
 
 		 421 aa  53.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.06 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.06 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  27.44 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  25.2 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  46.27 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  44.32 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  28.14 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  20.14 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  25.2 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.54 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  42.67 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  29 
 
 		 453 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>