More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1769 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  313  6e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  48.72 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  47.74 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42.11 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  43.06 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  43.24 
 
 		 166 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  41.06 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  41.5 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  44.3 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  38.78 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  38.82 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  36.13 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  36.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.23 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  37.09 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.49 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.27 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.13 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.77 
 
 		 290 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  32.41 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  31.79 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  26.17 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.77 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.24 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.61 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  31.13 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  31.13 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.67 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.39 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  29.08 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.41 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  28.1 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  30.2 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  32.28 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.93 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.9 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.67 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.28 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.87 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  32.68 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.56 
 
 		 295 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.85 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  27.4 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.45 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.58 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 297 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.78 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.13 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.79 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  24.53 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.25 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.82 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.45 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.9 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30.87 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  27.21 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  31.51 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.14 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>