More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0160 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  35.83 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 423 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  26.09 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  20.39 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  37.93 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  27.17 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  24 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 421 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  39.66 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  23.81 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  24 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  39.66 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>