134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0798 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  38.04 
 
 
211 aa  104  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  37.42 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  37.42 
 
 
211 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  36.81 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  36.81 
 
 
211 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  36.2 
 
 
211 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  32.72 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  24.4 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27.68 
 
 
200 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 
201 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  22.75 
 
 
186 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 
215 aa  60.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  32.31 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  22.73 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  24.58 
 
 
201 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  29.24 
 
 
200 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 
186 aa  57.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.41 
 
 
846 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  24.07 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  23.98 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 
199 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0992  hypothetical protein  40.58 
 
 
119 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  25.19 
 
 
214 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  20.93 
 
 
206 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  26.17 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  25.83 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 
193 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 
197 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  27.27 
 
 
1048 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  29.69 
 
 
191 aa  51.6  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 
190 aa  51.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  27.27 
 
 
1048 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  24.24 
 
 
453 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  23.23 
 
 
242 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  24.85 
 
 
370 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 
218 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  24.84 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  23.68 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  23.64 
 
 
485 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0991  hypothetical protein  34.41 
 
 
95 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  24.24 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  22.58 
 
 
242 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  27.21 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  27.33 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  24.12 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  19.53 
 
 
206 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  23.39 
 
 
227 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  23.64 
 
 
452 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
356 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  25.15 
 
 
187 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
844 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  24.78 
 
 
189 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 
349 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  24.42 
 
 
196 aa  47.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 
199 aa  47.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
233 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  22.67 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  23.26 
 
 
204 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 
452 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 
601 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 
949 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  22.4 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  23.12 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  24.81 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 
449 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  25.83 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  24.03 
 
 
320 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  21.91 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
825 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
862 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
825 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
825 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
825 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
825 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  23.74 
 
 
343 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.33 
 
 
401 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  23.74 
 
 
343 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.33 
 
 
401 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  28.57 
 
 
1039 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1811  IcmE protein  28.57 
 
 
1034 aa  44.3  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  23.08 
 
 
220 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 
225 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  24.37 
 
 
408 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 
220 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  27 
 
 
225 aa  44.3  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  23.23 
 
 
825 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>