More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2103 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 350 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  63.34 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  42.12 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  42.6 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  40.63 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  47.45 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  41.44 
 
 		 372 aa  205  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  39.22 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  40.99 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.8 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.46 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  36 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  37.78 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  41.31 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  43.98 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  35.51 
 
 		 400 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  39.78 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  40.09 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  37.75 
 
 		 425 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  32.96 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  30.42 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  28.53 
 
 		 630 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 		 410 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.46 
 
 		 1087 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  29.5 
 
 		 705 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  29.84 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.57 
 
 		 1087 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  35.15 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.01 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 		 800 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  33.95 
 
 		 846 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  32.39 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  32.39 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.29 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  32.39 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  32 
 
 		 1100 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.06 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.32 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.62 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.31 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.21 
 
 		 549 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.78 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.78 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 754 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.3 
 
 		 637 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06030  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.17 
 
 		 567 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486099  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  27.16 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  29.12 
 
 		 708 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.24 
 
 		 706 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.4 
 
 		 566 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  27.55 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.91 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.18 
 
 		 708 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  28.66 
 
 		 618 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.39 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  28.51 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  30.68 
 
 		 535 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  30.94 
 
 		 1079 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 697 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  27.25 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  29.26 
 
 		 644 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.67 
 
 		 590 aa  69.3  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  30.8 
 
 		 657 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  34.11 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 		 797 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  31.09 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.18 
 
 		 583 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  30.42 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  30.8 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.04 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  25.79 
 
 		 716 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.99 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  27.6 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  27.94 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  30.22 
 
 		 1082 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.64 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.2 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 583 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.67 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  26.19 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  33.02 
 
 		 405 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  33.76 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 		 614 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  29.15 
 
 		 693 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.85 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.47 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  28.75 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  27.2 
 
 		 687 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  29.15 
 
 		 694 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  28.68 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 		 817 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>