More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2314 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  72.41 
 
 
209 aa  310  7.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  71.15 
 
 
208 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  53.23 
 
 
207 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  50.25 
 
 
208 aa  217  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  50.75 
 
 
207 aa  214  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 
207 aa  214  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  55.31 
 
 
209 aa  208  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  49.24 
 
 
215 aa  207  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  51.38 
 
 
198 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  51.38 
 
 
199 aa  204  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 
203 aa  204  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  49.52 
 
 
210 aa  204  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  53.07 
 
 
201 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  47.26 
 
 
276 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
210 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 
210 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  43.58 
 
 
209 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  48.59 
 
 
150 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
259 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  39.11 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  38.42 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 
206 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  37.31 
 
 
211 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  38.12 
 
 
215 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 
211 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 
204 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  38.62 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
227 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
197 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  36.67 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  35.33 
 
 
205 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
197 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
239 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  34.46 
 
 
262 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 
251 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  32.81 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
180 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
180 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  27.13 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  32.43 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.8 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  29.95 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  30.81 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  33.88 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  33.96 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  27.8 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  31.74 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  24.74 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  31.49 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  31.18 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  25.64 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  38.41 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  24.6 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  25.64 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  30.26 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  25.27 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  31.49 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  29.53 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  27.47 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.98 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.65 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.77 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  27.37 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.22 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>