More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0859 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  100 
 
 		 362 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  69.42 
 
 		 372 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  66.39 
 
 		 364 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  68.96 
 
 		 364 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  68.6 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  69.04 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  68.77 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  55.92 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  55.37 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  56.2 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  57.34 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  54.57 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  56.56 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  56.82 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  58.84 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  54.52 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.43 
 
 		 365 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  38.51 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.55 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.13 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 340 aa  156  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.11 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 442 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 528 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.88 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.85 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  29.71 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.53 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.05 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 350 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  30.51 
 
 		 361 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.91 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 415 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 437 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.94 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.55 
 
 		 419 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  30.5 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  29.41 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.64 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>