More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1486 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  100 
 
 		 833 aa  1665    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  67.78 
 
 		 820 aa  1087    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  43.32 
 
 		 769 aa  665    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  71.24 
 
 		 851 aa  1165    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  65.31 
 
 		 829 aa  1071    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  64.4 
 
 		 836 aa  1032    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  36.8 
 
 		 763 aa  505  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  34.87 
 
 		 749 aa  476  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  34.67 
 
 		 751 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  34.91 
 
 		 749 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  43.7 
 
 		 938 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  45.92 
 
 		 749 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  32.13 
 
 		 776 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  31.89 
 
 		 808 aa  426  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  42.91 
 
 		 745 aa  412  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.05 
 
 		 756 aa  402  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  41.45 
 
 		 750 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  41 
 
 		 751 aa  385  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  40.99 
 
 		 754 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 		 502 aa  249  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.68 
 
 		 1565 aa  212  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 1528 aa  200  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  28.36 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  26.06 
 
 		 971 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  26.88 
 
 		 941 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  34.3 
 
 		 217 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  32.56 
 
 		 216 aa  107  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  32.87 
 
 		 234 aa  101  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  32.86 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  32.86 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  31.13 
 
 		 212 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29.3 
 
 		 228 aa  95.5  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  29.49 
 
 		 233 aa  91.3  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  30.19 
 
 		 212 aa  90.5  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  31.79 
 
 		 230 aa  87  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  34.6 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  30.41 
 
 		 246 aa  79  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  33.89 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.14 
 
 		 591 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  30.82 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  34.67 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  29.05 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  30.57 
 
 		 214 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  27.67 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  31.11 
 
 		 216 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  31.5 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  32.35 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  26.6 
 
 		 343 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.62 
 
 		 435 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  27.15 
 
 		 797 aa  63.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  34.13 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  34.43 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  36.67 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  37.37 
 
 		 668 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  28.71 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 467 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 609 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1226  excinuclease ABC, B subunit  37.82 
 
 		 657 aa  62  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.56679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.45 
 
 		 545 aa  62  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  36.05 
 
 		 975 aa  61.6  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  37.3 
 
 		 679 aa  62  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.45 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.57 
 
 		 744 aa  62  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  38.53 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  34.19 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4967  excinuclease ABC subunit B  30.66 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 744 aa  61.2  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  29.78 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  29.73 
 
 		 1269 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3217  excinuclease ABC subunit B  36.84 
 
 		 675 aa  60.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  32.5 
 
 		 993 aa  60.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.35 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.68 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  38.6 
 
 		 675 aa  60.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.68 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  33.6 
 
 		 158 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  31.58 
 
 		 436 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.68 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.89 
 
 		 627 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.89 
 
 		 627 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.68 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  27.75 
 
 		 215 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1426  excinuclease ABC subunit B  28.99 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.71 
 
 		 626 aa  60.1  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  34.95 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.71 
 
 		 626 aa  60.1  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.37 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1242  excinuclease ABC, B subunit  37.17 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.31 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  32.28 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  29.47 
 
 		 676 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.23 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.75 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1430  excinuclease ABC subunit B  31.44 
 
 		 671 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>