More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1844 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
574 aa  1137    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.22 
 
 
776 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  60 
 
 
677 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.88 
 
 
609 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.29 
 
 
545 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.31 
 
 
545 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.36 
 
 
596 aa  598  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  56.18 
 
 
691 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.18 
 
 
593 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  57.81 
 
 
679 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  57.17 
 
 
659 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.71 
 
 
659 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.16 
 
 
651 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.21 
 
 
577 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.46 
 
 
583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.87 
 
 
691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  56.25 
 
 
656 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.58 
 
 
787 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  56.55 
 
 
590 aa  558  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.39 
 
 
568 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.39 
 
 
568 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  56.33 
 
 
673 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.21 
 
 
626 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.45 
 
 
626 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.03 
 
 
626 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.77 
 
 
644 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.92 
 
 
687 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.45 
 
 
610 aa  531  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.25 
 
 
567 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  55.34 
 
 
710 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.27 
 
 
764 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  52.04 
 
 
706 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.42 
 
 
585 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.6 
 
 
793 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.45 
 
 
730 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.23 
 
 
505 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.95 
 
 
565 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.95 
 
 
565 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  56.36 
 
 
602 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  55.05 
 
 
565 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  62.77 
 
 
340 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.14 
 
 
550 aa  277  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.05 
 
 
558 aa  273  7e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 
527 aa  267  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 
574 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.93 
 
 
584 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31 
 
 
565 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  31.33 
 
 
656 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  36.45 
 
 
561 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.01 
 
 
528 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.01 
 
 
528 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
619 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.53 
 
 
643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 
622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.14 
 
 
622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.51 
 
 
623 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.52 
 
 
562 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.95 
 
 
637 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.22 
 
 
550 aa  253  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.99 
 
 
623 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.53 
 
 
532 aa  252  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.32 
 
 
527 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  33.14 
 
 
572 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.32 
 
 
527 aa  251  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  33.59 
 
 
583 aa  250  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.46 
 
 
590 aa  250  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 
546 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.96 
 
 
640 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
640 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
640 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.78 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.2 
 
 
530 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.87 
 
 
607 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  33.02 
 
 
589 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 
546 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.7 
 
 
536 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 
557 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.78 
 
 
611 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.56 
 
 
595 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.01 
 
 
557 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.01 
 
 
557 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 
541 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 
532 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.17 
 
 
590 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.35 
 
 
597 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.89 
 
 
561 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.4 
 
 
625 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.95 
 
 
747 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 
599 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 
605 aa  246  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.82 
 
 
602 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.23 
 
 
579 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.64 
 
 
694 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.27 
 
 
533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.27 
 
 
632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.95 
 
 
589 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.27 
 
 
624 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
634 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 
610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>