More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1832 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  73.14 
 
 
590 aa  789    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 
610 aa  1212    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.42 
 
 
593 aa  668    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.29 
 
 
609 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.32 
 
 
776 aa  592  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.17 
 
 
545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.07 
 
 
545 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  51.55 
 
 
677 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  52.97 
 
 
659 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  54.91 
 
 
691 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.71 
 
 
787 aa  565  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.95 
 
 
596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  56.52 
 
 
656 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.09 
 
 
583 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  56.29 
 
 
679 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.43 
 
 
659 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.71 
 
 
651 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  49.57 
 
 
673 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.4 
 
 
691 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.48 
 
 
644 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.22 
 
 
626 aa  531  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.79 
 
 
568 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.79 
 
 
568 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.04 
 
 
626 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.17 
 
 
577 aa  528  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.73 
 
 
626 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.24 
 
 
567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.79 
 
 
574 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.09 
 
 
764 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.18 
 
 
793 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.62 
 
 
687 aa  502  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.58 
 
 
585 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  50.18 
 
 
710 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.53 
 
 
730 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  47.8 
 
 
706 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.76 
 
 
565 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.56 
 
 
565 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  54.26 
 
 
602 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.06 
 
 
505 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  53.55 
 
 
565 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  60.07 
 
 
340 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.85 
 
 
533 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.51 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
643 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.43 
 
 
624 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.64 
 
 
584 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.1 
 
 
664 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.1 
 
 
664 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.1 
 
 
664 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.31 
 
 
532 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.05 
 
 
530 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  37.95 
 
 
579 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.94 
 
 
621 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.79 
 
 
550 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.59 
 
 
595 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.72 
 
 
527 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.88 
 
 
527 aa  267  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.08 
 
 
527 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
571 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
529 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.18 
 
 
514 aa  264  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.3 
 
 
632 aa  265  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.43 
 
 
570 aa  263  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
590 aa  263  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.81 
 
 
625 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.23 
 
 
629 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.23 
 
 
629 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.23 
 
 
629 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  32.89 
 
 
589 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.17 
 
 
637 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.05 
 
 
629 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.87 
 
 
629 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  33.87 
 
 
629 aa  261  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.87 
 
 
629 aa  261  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.23 
 
 
629 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.87 
 
 
629 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.87 
 
 
629 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  33.87 
 
 
629 aa  261  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.87 
 
 
651 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.87 
 
 
651 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.87 
 
 
651 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  32.9 
 
 
601 aa  259  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.62 
 
 
528 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.62 
 
 
528 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  36.62 
 
 
528 aa  259  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.62 
 
 
528 aa  259  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.88 
 
 
653 aa  259  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  36.62 
 
 
533 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  36.62 
 
 
528 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.88 
 
 
591 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.62 
 
 
525 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.62 
 
 
525 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  34.46 
 
 
636 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  31.49 
 
 
656 aa  258  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 
559 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.45 
 
 
530 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.92 
 
 
538 aa  257  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  33.95 
 
 
641 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 
599 aa  256  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  33.09 
 
 
591 aa  256  8e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>